Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C10orf55Q5SWW7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms