Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms