Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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