Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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