Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DSG2Q14126 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG2Q14126 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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