Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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