Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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