Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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