Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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GTF3C1Q12789 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3C1Q12789 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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