Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX6P78412 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms