Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms