Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDKN1BP46527 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms