Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP2K4P45985 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms