Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms