Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms