Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms