Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms