Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms