Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms