Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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