Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM10L2BP0DMW5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms