Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QRK9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QRK9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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