Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPN6Q9Y6Q1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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