Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms