Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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