Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms