Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms