Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSHZ2Q9NRE2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms