Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COMMD5Q9GZQ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COMMD5Q9GZQ3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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