Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms