Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms