Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms