Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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