Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms