Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX54Q8TDD1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms