Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms