Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLASP1Q7Z460 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLASP1Q7Z460 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms