Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms