Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCN10Q6JVE6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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LCN10Q6JVE6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCN10Q6JVE6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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