Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCSAPQ6IQ19 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms