Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGAP9Q5VTM2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms