Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms