Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF1Q3BBV0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms