Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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