Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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