Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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