Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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