Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ST3GAL4Q11206 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ST3GAL4Q11206 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms