Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGNL1Q0VF96 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms