Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms